عند تمكين Windows 2000 Terminal Services في وضع ملقم التطبيق، تطلب بعض التطبيقات إجراء تعديلات في الإعداد لأمثلية العمل. وفي الوقت الذي تبذل فيه Microsoft وموفر هذه البرامج النصية كل الجهود الممكنة للتأكد من صحة عمل كل مكوّن من التطبيق على الملقم الطرفي، قد يكون من الضروري أحيانًا الاتصال بمطور التطبيق لحل بعض المشاكل المعينة.
عند تثبيت Lotus Notes 4.x على ملقم Windows 2000 الذي يقوم بتشغيل خدمات المحطة الطرفية في وضع ملقم التطبيق، يطلب التطبيق تغييرات ثانوية بعد التثبيت. يجب تثبيت Lotus Notes 4.x باستخدام طريقة معينة للوصول إلى أفضل توافق مع الخدمات الطرفية. حيث تفصل طريقة التثبيت هذه ما بين البيانات المخصصة للمستخدم وبيانات النظام العامة بطريقة صحيحة.