Gdy w trybie serwera aplikacji włączone są usługi terminalowe systemu Windows 2000, niektóre aplikacje mogą wymagać modyfikacji ustawień, aby optymalnie pracować. Chociaż firma Microsoft oraz dostawca tych skryptów podejmują wszelkie starania, aby zapewnić prawidłową pracę każdego składnika aplikacji na serwerze terminali, może być konieczny kontakt z deweloperem określonej aplikacji w celu rozwiązania pewnych problemów.
W przypadku gdy program Power Builder 6.0 został zainstalowany w systemie Windows 2000 Server z uruchomionymi usługami terminalowymi w trybie serwera aplikacji, aplikacja wymaga niewielkich zmian po instalacji. Program PowerBuilder 6.0 nie obsługuje wielu działających równocześnie użytkowników z uruchomionymi przykładowymi kodami (Code Examples) w folderze programu PowerBuilder 6.0.
Uwaga Każde dostosowanie programu PowerBuilder 6.0 dokonane przez jednego użytkownika wpływa na ustawienia wszystkich użytkowników programu PowerBuilder 6.0.