A .NET Framework é bem mais segura que o Windows tradicional em diversos aspectos. Por exemplo, os aplicativos .NET são usualmente imunes a estouros de buffer, algo comum em programas C/C++ não-gerenciados.
Isso, no entanto, não evita erros como injeção de comandos SQL nem problemas com entradas de dados discutidos anteriormente.
Existem também algumas questões específicas no uso da plataforma .NET.